Функция FS_GetRoot используется для получения указатель на имя каталога, с которого начался обход диска. Этот указатель должен передаваться функции RRE_Fill, если вы используете оператор получения относительного имени каталога в регулярном выражении для замены. Имеет смысл пользоваться этой функцией только до тех пор, пока не прекратила работать функция FS_Search, т.е. вызывать FS_GetRoot нужно только из функций-обработчиков: FSPROCESSCHANGEDIRCALLBACK, FSPROCESSITEMCALLBACK.
const char * WINAPI FS_GetRoot(const CFileSearch *fs);